Институт судебной экспертизы широко взаимодействует с Учебно-научным комплексом судебной экспертизы Московского университета МВД России имени В.Я. Кикотя. На базе УНК судебной экспертизы институт готовит высококвалифицированных специалистов с использованием современной, постоянно обновляющейся учебно-материальной базы, включающей в себя лекционные и учебные аудитории, более 20 специализированных учебных лабораторий, учебно-практический полигон комплексной подготовки сотрудников полиции и т.д.